JCIM | 算力大增的时代考虑绝对自由能计算提高虚拟筛选准确率
文章简介 药物发现中的虚拟高通量筛选(vHTS)是一种识别苗头化合物的有效方法,它可以比实验性高通量筛选方法更快,更便宜。但是,主流的vHTS工…… Continue reading
文章简介 药物发现中的虚拟高通量筛选(vHTS)是一种识别苗头化合物的有效方法,它可以比实验性高通量筛选方法更快,更便宜。但是,主流的vHTS工…… Continue reading
背景 据统计类药库含有超过10^60个分子。目前没有任何可用的技术能够筛选出此规模的分子库。因此,基于片段的药物设计(FBDD)自20世纪90年…… Continue reading
引言 新兴病毒如登革和寨卡等都可以引起大范围的病毒传播。作为绝对寄生体,所有病毒有共同的细胞途径,这为开发广谱抗病毒药提供了靶向宿主因子的可能性…… Continue reading
引言 通常用于治疗新疾病(例如COVID-19)的药物重定向通常始于对现有药物进行虚拟筛选,然后进行实验验证,但是使用传统的计算方法,实际命中率…… Continue reading
引言 虚拟筛选方法的比较评估需要在不同的、现实的和公正的数据库上执行严格的基准程序。许多研究表明,使用经典的人工构建的配体集(例如DUD、DUD…… Continue reading
引言 肿瘤发生与免疫逃逸密切相关,免疫治疗已成为重要的肿瘤治疗方法之一。吲哚胺2,3-双加氧酶1 (indoleamine 2,3-dioxyg…… Continue reading
引言 褪黑激素受体(G蛋白偶联受体MT1和MT2)与人体昼夜节律的生理功能相关,可作为睡眠障碍和抑郁患者的药物靶点,作者基于MT1晶体结构,从1…… Continue reading
先睹为快 靶点 PPARα:过氧化物酶体增殖物激活受体α(PDB ID:3ET1和3SP6) 数据库 ChemDiv数据库(140万个小分子) …… Continue reading
先睹为快 靶点 FLAP:5-脂氧合酶激活蛋白(PDB ID:2Q7M) 数据库 Molport数据库(6255980个小分子) ChEMBL数…… Continue reading
背景 热休克蛋白90(Hsp90)是一种众所周知的依赖ATP的蛋白,可实现细胞在体内的平衡,Hsp90蛋白在癌细胞的生长和增殖中起着重要作用。此…… Continue reading