JCIM | 蛋白-多肽对接软件的基准测试
引言 蛋白-多肽相互作用涉及许多细胞生理和病理过程，大多数治疗性多肽因其具有高生物活性和低毒性而广受制药业青睐。分子对接作为基于结构的药物设计（…… Continue reading
第一轮通知 | 第十届国际分子模拟与信息技术应用学术会议
作为国内历史最悠久、分子模拟领域公认的高水平国际学术会议，国际分子模拟与信息技术应用学术会议重磅回归。经过两年的精心筹备，本次会议将于2020年…… Continue reading
Science丨基于结构的药物设计发现新型抗SARS-CoV-2病毒抑制剂
引言 新型冠状病毒（SARS-CoV-2）已在全球范围内爆发，该流行病迅速传播到212个国家，并被世卫组织宣布为全球卫生紧急情况。目前还没有临床…… Continue reading
Nature Communications丨理性设计抗卡波氏肉瘤vFLIP-NEMO蛋白-蛋白相互作用抑制剂
引言 蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）指一种蛋白质对另一种蛋白质的选择性识别，其控制着细胞生命的三个关键维度：生长、存活和分化。这些相互作用的…… Continue reading
JMC | 靶向TLR8蛋白-蛋白界面抑制剂的理性设计
引言 本文针对Toll样受体8二聚体结合表面的口袋，开展基于结构的理性药物设计发现活性化合物，进一步结构改造得到高选择性强效TLR8抑制剂。 先…… Continue reading
JMC | 赛诺菲研究基于AI的分子从头设计
引言 AI为化合物的属性预测，药物设计以及分子逆合成提供了有效的解决方案，来自赛诺菲的Christoph Grebner在JMC专刊Artifi…… Continue reading
Nature Methods | 基于几何深度学习的蛋白表面相互作用指纹及其应用
引言 基于结构来预测蛋白质与其他生物分子之间的相互作用仍然是生物学中的热点问题。蛋白质结构的surface表征已被长期用于研究蛋白相互作用，并且…… Continue reading
ChemSci | 理论计算结合实验解析细胞色素氧化酶的质子通道激活机制
引言 细胞色素氧化酶是一种氧化还原偶联的质子泵，具有重要的生物学功能。作者通过研究质子化和水动力学，以及通道入口的构象动力学，结合实验和计算方法…… Continue reading
DDT | 药物机理和安全性的多尺度模拟
引言 瑞士罗氏创新中心Jitao David Zhang等人在Drug Discovery Today综述了基于分子、细胞、器官级别的多尺度建模…… Continue reading
JMC | 诺华人工智能启发式药物发现推荐系统
简介 诺华在内的许多制药公司正在将人工智能，机器学习和其他预测技术应用于药物发现。例如，将机器学习应用于组织样品中疾病的分析过程，确定潜在的药物…… Continue reading