先睹为快 现在，像Amgen这样的公司现在都是通过借鉴自然界中已有的蛋白结果来设计蛋白质，但David Baker的IPD（蛋白质设计研究所）开…… Continue reading →

背景 热休克蛋白90（Hsp90）是一种众所周知的依赖ATP的蛋白，可实现细胞在体内的平衡，Hsp90蛋白在癌细胞的生长和增殖中起着重要作用。此…… Continue reading →

虚拟筛选 虚拟筛选是利用计算机模拟药物筛选过程，对化合物的活性做出预测，可从大型化合物库中迅速筛选出有潜在活性的候选药物。目前用到的虚拟筛选方法…… Continue reading →

前言 在过去的二十年中，靶向共价抑制的研究备受关注，以加强药物的发现和设计，使得共价对接方法的发展也激增。共价抑制剂的典型特征是配体的亲电部分（…… Continue reading →

先睹为快 靶点 胰高血糖素样肽1-受体（GLP-1R） 计算方法 分子对接，分子建模 计算软件 Schrödinger，MOE，Cubist 单…… Continue reading →

背景 经典的分子动力学（MD）模拟被广泛用于研究化学和生物系统的物理性质。MD模拟中的基本要素之一是力场（FFs）的精度，其中包括描述分子内和分…… Continue reading →

静电势表面 众所周知，分子的静电性质可以用于预测分子的化学反应性及分子间相互作用力。一般来说，分子ESP表面是通过在分子表面上移动单位电荷探针生…… Continue reading →

背景 打分函数广泛应用于基于结构的计算辅助药物设计，其通过定量化评估药-靶的相互作用为药物研发中的药效评估提供理论依据[1-5]，提高活性化合物…… Continue reading →